充满阳光的沙漠，楼兰废墟就在远处。
从纲手那里接到协助砂忍村抓捕叛忍傀儡师百足的命令，鸣人、佐井、小樱，还有他们的队长大和，四人一路追踪赶路。
在来的路上，木叶四人小队和百足的傀儡发生了几场战斗。
当几人进入楼兰封印之地的时候，百足正在施术破解四代留下的封印。
鸣人与大和上前阻止，谁曾想百足竟然解开了四代水门的封印！鸣人直接被时空乱流卷入其中。
大和用木遁抓住了鸣人，可是时空乱流的力量太大，他也被卷入其中。
小樱在接近时空乱流的位置被佐井救下，两个人懊悔不已。
不过下一刻，两人就看到了躺在封印之地的鸣人也大和。
鸣人和大和被小樱唤醒，问清楚情况，原来他们随着时空乱流被卷入过去。
鸣人和大和回到了木叶四十年，楼兰古城还在的时空。
鸣人碰见了楼兰女王，并且在年轻时的波风水门、秋道丁座、油女志弥和六岁的中忍卡卡西帮助下，打败了同样是未来回到过去的安禄山（也就是百足）。
最后，波风水门封印龙脉的力量，鸣人和大和也回到了未来时空。
鸣人讲完自己的经历，他们刚刚走出楼兰遗址，四人就看到了远处天边坠落的天碍震星。
“那是什么？”
“好像月亮掉下来一样！”
“离村子不远，我们快去看看！”
四人奔向天碍震星方向。
……
电影就是这么短的时间。
……
布莱德利吕牧穿过大气层，他加速飞向太阳的方向。
布莱德利吕牧飞入方舟飞船金字塔，石床上白绝和一边的天启带土还是连体婴的状态，黑棒插满天启带土身上，黑棒限制住两人都听不懂，不过天启带土的意识却在外面。
“天启，你的能力杀不死白绝吗？”布莱德利吕牧说道。
“白绝就像是孢子植物一样，他能寄生繁殖！红吕牧和蓝吕牧意识对他不起作用。把妖莲拿出来，让白吕牧们试试对付他！我的英雄背包中什么都没有！”天启勉强开口说道。